Schon 1906 wurde die Reubke-Orgel durch ein 100-registriges Instrument von Ernst Röver ersetzt, das dieser in der von Adolf Reubke übernommenen Werkstatt in Hausneindorf bei Quedlinburg gebaut hatte. Kurz vor dem zweiten Weltkrieg entsprach auch diese Orgel schon nicht mehr dem Zeitgeschmack. Zum beabsichtigten Abriss kam es aber nicht mehr, weil im Februar 1945 durch einen Bombentreffer ein riesiges Loch in die Westfront des Domes gerissen und dabei auch die Orgel völlig zerstört wurde.

 Nach einem Plan von Landeskirchenmusikdirektor Bremsteller aus den 1950er Jahren sollten im wiederhergestellten Dom zwei Orgeln errichtet werden: auf der Westempore traditionell die große Hauptorgel und eine kleine „Gegenorgel" auf dem Bischofsgang. Aus finanziellen und gesellschaftspolitischen Gründen kam es jedoch nie dazu.